Un peu comme sa sœur la Loire dont elle est le principal affluent, l’Allier est souvent considérée comme « l’une des dernières grandes rivières sauvages d’Europe ». Dotée d’un parcours très varié sur 425 km de long et d’un bassin versant de 14 310 km², l’Allier prend sa source en Lozère (Le Moure de la Gardille) jusqu’à sa confluence avec la Loire au Bec d’Allier.
L’Ecopôle du Val d’Allier, se situe en rive gauche de la rivière Allier sur sa partie avale. Dans cette partie, l’Allier est principalement une rivière de plaine et se distingue du Haut-Allier par une forte anthropisation avec la présence de pôles urbains importants (Issoire, Clermont-Ferrand, Vichy, Moulins) et de nombreuses activités socio-économiques.